Mezinárodní doktorát ve strukturální biologii

International Doctorate in Structural Biology je mezinárodní doktorát ve spolupráci s univerzitami ve Frankfurtu a Utrechtu. Bylo založeno dohodou podepsanou třemi rektory v roce 2001. Na základě této dohody je titul PhD, který studenti získají na konci programu, považován za rovnocenný titulu získanému v Bijvoet Center for Biomolekulární výzkum a titul PhD. v oboru chemie a biochemie z Frankfurtské univerzity.

Doktorský kurz je zaměřen na formování doktorandů, kteří jsou v popředí znalostí a vzdělání v oblasti moderních vyšetřovacích metodologií ve strukturní biologii, biotechnologii a systémové biologii. Poskytuje bohaté poznatky pro školení odborníků v oblasti strukturní chemie aplikované na biologické makromolekuly v roztoku, ve fibrilách, v membránách nebo v buňkách a v oblasti molekulární biologie pro expresi izotopově obohacených rekombinantních proteinů.

Hostitelská instituce

Centrum magnetické rezonance (CERM) University of Florence je výzkumná infrastruktura podporovaná Evropskou komisí pro poskytování nadnárodního přístupu k biologické NMR. CERM je jednou z prvních laboratoří na světě pro kvalitu vybavení, výrobu a vědeckou důvěryhodnost v oblasti strukturní biologie a NMR. Infrastruktura je unikátně vybavena velkým počtem NMR spektrometrů v rozsahu od 1200 MHz až do 0,01 MHz, přes 950, 900, 850 WB, 800, 700, 600, 500 a 400 MHz spektrometry. Mnoho z těchto nástrojů je vybaveno kryosondou. Má specializovanou tradici ve výzkumu metaloproteinů, zejména paramagnetických metaloproteinů. CERM je hlavním členem INSTRUCT, evropské infrastruktury pro integrovanou strukturální biologii, která zahrnuje centra pro špičkové technologie, vědecké expertizy a školení.

Studenti jsou trénováni na rozhraní mezi biologií a anorganickou chemií prostřednictvím biopočítačů a spektroskopie. Dlouhodobým vzdělávacím cílem je vytvořit vědce schopné zasadit konkrétní problémy do obecného kontextu, považovat multidisciplinaritu za primární potřebu a považovat nadnárodní spolupráci za požadavek na rozvoj soudržné generace evropských vědců.

Základem kurzu jsou tyto předměty:

• Nukleární magnetická rezonance (v roztoku i v pevném stavu) a rentgenová krystalografie pro studium struktury, funkce a dynamiky biologických makromolekul, interakce protein-protein;
• Molekulární biologie a techniky buněčné biologie pro přípravu a manipulaci s proteiny, DNA a bakteriálními konsorcii;
• vývoj nových léků prostřednictvím technik návrhu léků;
• Bioinformatika jako základní strategie pro studium kinetických a termodynamických jevů a dynamiky proteinů, pro učení a vývoj metod pro využití genomických databází za účelem identifikace molekulárních cílů pro vývoj nových léků;
• metabolomika.

Doktorský program se opírá o spolupráci výzkumných skupin z univerzit v Utrechtu, Frankfurtu, Lyonu a Oxfordu, které patří v oblasti strukturní biologie k nejvýznamnějším na světě.

Cílem kurzu je poskytnout vysoce kvalitní a multidisciplinární výzkumnou přípravu v oblasti strukturní biologie. Aby toho bylo dosaženo, kurz zahrnuje velmi široký integrovaný program, který zahrnuje odborné znalosti v chemii, biologii, biofyzice, medicíně a informatice, který je schopen řešit aktuální výzvy v oboru od základních problémů až po aplikace. Nová generace doktorandů bude vychovávána tak, aby považovala multidisciplinární výzkum, nadnárodní spolupráci a integraci různých technik za primární potřeby pro rozvoj excelentního výzkumu.

Strukturální biologie je klíčem k inovacím v biotechnologiích, potravinářských technologiích a biomedicínských aplikacích. Hraje hlavní roli v porozumění mechanismu účinku terapeutik a usnadňuje navrhování inovativních léků a biologických látek působících na specifické molekulární cíle. Počínaje určováním trojrozměrných struktur makromolekul se strukturální biologie vyvinula ke studiu dynamiky makromolekul a makromolekulárních mechanismů a jejich uvedení do buněčných souvislostí. Poskytuje vizualizaci biomolekul a způsobu jejich funkce na atomové úrovni. Farmaceutické společnosti mají oddělení strukturní biologie zapojená do různých fází ropovodů objevování léků. Ve skutečnosti oblasti, jako jsou informované léky a nové vakcíny, často zásadně závisí na strukturálních datech.

Očekává se, že v budoucnu budou odhaleny větší a větší molekulární systémy a stále složitější biologické jevy prostřednictvím integrativních strukturálních biologických přístupů, které kombinují komplementární experimentální a výpočetní nástroje.

Uchazeči budou proškoleni, aby

• získat solidní společné vědecké zázemí v oblasti strukturální biologie,
• absolvovat pokročilý a cílený výzkum založený na infrastruktuře v jejich metodologii výzkumu
• Účastnit se a propagovat jejich výzkum na mezinárodních konferencích
• sdělovat výsledky své práce v mezinárodních publikacích
• rozšířit své obzory prostřednictvím široké škály kurzů a seminářů
• stimulovat mezioborovou spolupráci
• stimulovat mobilitu a nadnárodní spolupráci
• Získejte nevědecké školení pro lepší kariérní perspektivy
• se vyvinou v kvalifikované, otevřené a nezávislé mladé výzkumníky.