Přírodovědecká fakulta byla založena v roce 1920 jako pátá fakulta Univerzity Karlovy. V současné době má 29 oddělení, 3 muzea a velkou botanickou zahradu, kde jsou umístěny studijní oddělení a některé studentské zařízení.

V současné době je fakulta akademicky a organizačně rozdělena do čtyř částí: biologická, geografická, geologická a chemická. Kromě těchto oddělení má fakulta několik specializovaných pedagogických a výzkumných center včetně interdisciplinárních institucí, jako je Institut pro environmentální studia. Všechny části fakulty jsou aktivní ve výuce i výzkumu.

Hlavním posláním Přírodovědecké fakulty je vytvoření vysoce kvalifikovaných odborníků z oblasti biologie, chemie, geografie, geologie a dalších interdisciplinárních oborů. Jeho vědecké a výzkumné úsilí má za cíl vyřešit klíčové problémy spojené s rozvojem lidské společnosti. Některé z prioritních dlouhodobých témat jsou lidské zdraví, studium funkce a předpovědi vývoje ekosystémů a biosféry a vývoj ekologických materiálů založených na využití obnovitelných zdrojů.

Přírodovědecká fakulta nabízí tři úrovně vzdělání, bakalářské, magisterské a doktorské. Všechny bakalářské a magisterské programy zahrnují jak teoretické výuky, tak i praktické cvičení v laboratořích, a některé kurzy spojují akademické studium přírodních věd s výukou učitelů ve vybraném oboru. Bakalářské kurzy jsou úvodem k hlubším studiím, které následují v magisterských programech. Magisterské studijní programy připravují odborníky na vědecké a výzkumné ústavy, státní kariéru, průmysl a soukromý sektor. Absolventi magisterských studijních oborů s vyučujícím jsou schopni vyučovat na středních a středních odborných školách. Doktorské studijní programy připravují vysoce specializovaný personál pro vědeckou a výzkumnou činnost.